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財政部五十八年一月十七日(五八)臺財關第五五七號令修正
財政部五十九年十月二十九日(五九)臺財關第一七八八○號函修正
財政部六十二年六月二十二日(六二)臺財關第一六一三七號函修正
財政部六十三年十一月十九日(六三)臺財關第二一○一九號函修正
財政部六十五年十月十六日(六五)臺財關第二一三五七號函修正
財政部六十七年六月十六日(六七)臺財關第一六四四四號函修正
財政部七十年九月十四日(七十)臺財關第二一○七三號函修正
財政部七十三年九月十四日(七三)臺財關第二一六五五號函修正
財政部七十四年六月十八日(七四)臺財關第一七七二六號函修正
財政部七十六年五月五日臺財關第七六四二六一一號函修正
財政部八十年十一月八日臺財關第八○○四二七九九一號函修正
財政部八十二年十一月十七日臺財關第八二一五五七○八九號函修正
財政部八十四年五月五日臺財關第八四○一九四○九四號函修正
財政部八十五年二月二十八日臺財關第八五二○一二○四八號令修正
財政部八十六年十一月七日台財關八六二○○三八一○號令修正
財政部八十七年五月十三日臺財關第八七○一一一○六一號令修正
財政部八十七年九月八日臺財關第八七二○四八一六二號函修正
關稅總局八十七年九月十六日台總局徵字第八七一○七一○五號函修正
關稅總局八十八年十二月十四日台總局徵字第八八一○八二六七號函修正
關稅總局八十八年十二月二十一日台總局徵字第八八一○八四六三號函修正
關稅總局八十九年一月四日台總政徵字第八九六○○○○一號函修正
財政部九十年四月三十日台財關字第０九００五五０一九一號函修正
財政部九十年十二月三十日臺財關第○九○○五五○九四一號令修正發布
關稅總局九十一年一月七日臺總政徵字第九一六ＯＯ五五三號函修正
財政部九十一年二月八日台財關字第０九一０五五００九七號勘誤表
關稅總局九十一年二月二十五日台總政徵字第九一六ＯＯ六二八號函
財政部九十二年二月二十六日台財關字第0920550133號令修正
財政部九十三年二月十日臺財關第○九三○五五○○七四號令修正發布
財政部九十三年七月十六日臺財關字第○九三○五五○三九○○號令修正發布

本辦法所稱貨櫃，指供裝運進出口貨物或轉運、轉口貨物特備之容器，其構造與規格及應有之標誌與號碼，悉依國際貨櫃報關公約之規定。
貨櫃內裝有貨物者，稱實貨櫃；未裝有貨物者，稱空貨櫃；實貨櫃內所裝運之進口、轉運、轉口貨物如屬同一收貨人，或出口、轉口貨物如屬同一發貨人者，為整裝貨櫃；其進口、轉運、轉口貨物如屬不同一收貨人或出口、轉口貨物不屬同一發貨人者，為合裝貨櫃。
前項所稱同一收貨人，應以進口艙單記載者為準；所稱同一發貨人，應以出口艙單記載者為準。
本辦法所稱貨櫃集散站（以下簡稱集散站）指經海關完成登記專供貨櫃及櫃裝貨物集散倉儲之場地。

集散站應提供駐站或稽核關員辦公處所、辦公用具、備勤場所及駐站關員往來交通工具。
集散站得由海關依職權核定或由業者申請經海關核准實施自主管理，其實施自主管理之事項、範圍、應具備條件及其他應遵行事項，依有關法令規定辦理。
集散站實施自主管理應指定專責人員依海關相關規定辦理前項經海關核准實施自主管理之事項。海關得定期或不定期稽核之，其稽核作業依有關法令規定辦理。
集散站經海關核准自主管理者，海關不再派員駐庫（站），但於實施初期海關得派員指導。

貨櫃集散站經營業經交通部核准設立，應檢具下列文件，送經當地海關會同當地航政機關實地勘察後，核准登記為集散站。其專營或兼營轉口貨物者，以設置於港區範圍內與貨櫃碼頭相連之港口貨櫃集散站或碼頭專區為限。
一、申請書：應載明申請機關、公司或行號之名稱、地址、電話號碼及負責人銜稱、姓名及其住址。

二、集散站地點、建築構造、交通部核准設立面積範圍及站內布置圖說。

四、公司登記證明書、營利事業登記證及影本、集散站經營業許可證及其影本。

前項第三款及第四款之文件，除集散站經營業許可證外，如申請人為政府機關或公營事業者，得予免送。
集散站業者依交通部所核准設立面積範圍，應與外界有明顯之區隔。
經核准登記之集散站應於核准登記之翌日起十日內，向海關繳納保證金新台幣三十萬元，以完成登記。但集散站業者為政府機關或公營事業者，得予免繳。
前項保證金得以政府發行之公債、銀行定期存單、信用合作社定期存單、信託投資公司一年以上普通信託憑證(以上須設定質權於海關)或授信機構之保證抵充。
經完成登記之集散站，由海關發給集散站登記證後，仍應每兩年向海關辦理複勘及校正，複勘時，並由海關會同當地航政機關為之。登記證遺失時，應即申請補發。

集散站應設置貨櫃集中查驗區域以供海關查驗貨物。集中查驗區域之設置須有明顯標示，其面積、查驗場所、遮雨棚、照明燈具、機具、電源插座及其搬運工人等應配合海關查驗需要設置。新設立之集散站並應有固定式之拖靠月台。但設置於國際港口管制區內之集散站，其出口整裝貨櫃之查驗作業月台，得以活動式之平面拖靠月台替代。
集散站應設置電腦及相關連線設備以電子資料傳輸方式處理業務。其作業規定，由海關訂定並公告。

經完成登記之貨櫃集散站，因故須自行停業者，應向海關報備。其有下列情形之一者，應向主管機關辦理變更登記，並於核准變更登記之翌日起三十日內檢附公司登記證明書、營利事業登記證、集散站經營業許可證及其影本向海關辦理變更登記換發登記證：

一、變更名稱。
二、遷移地址。
三、變更負責人。
四、變更或增減營業項目。
五、增減資本額。
六、土地面積之增減。

進出口、轉運貨物及貨櫃在集散站之存放、移動及處理，依下列規定辦理：

一、集散站業者對於貨櫃及貨物進出集散站應依相關規定切實控管。

二、裝運進口貨物之合裝貨櫃，應於進入集散站之翌日起十日內拆櫃進倉。如櫃裝貨物經海關扣押者，其運輸業者得申請海關核准後拆櫃進倉。

三、存站之進出口合裝或整裝實貨櫃，如須轉儲另一集散站或聯鎖倉庫拆櫃進倉者，應由貨主、運輸業者檢具集散站業者轉站（倉）理由書及移站（倉）貨櫃及貨物清單，連同移入集散站或倉庫業者簽具之進站（倉）同意書及聯保單，向海關申請核發准單後始得憑以移運。

四、以貨櫃裝運之進口或轉運貨物卸存站內倉庫及已放行之出口貨物裝載貨櫃提出集散站，應於例假日以外每日上午六時至下午六時之內為之，欲於上列時間外進出集散站者，應在海關辦公時間內向海關申請核准後辦理。出口貨物存入站內倉庫及已放行進口或轉運貨物提出站內倉庫，除有特殊情形經海關核准者外，應在海關辦公時間內為之。

五、進出口、轉運貨櫃以層疊方式堆放者，實貨櫃與空貨櫃應分區堆放。實貨櫃並應按進出口、轉運櫃別堆放；以車架方式置放者，空貨櫃、實貨櫃得不分別分區排放，惟應以不同顏色之卡片標示進口櫃、轉運櫃、出口櫃及空貨櫃以利識別，集散站應於每日向海關監管單位提供貨櫃堆放動態表以資稽查。但存站之進、出口、轉運實貨櫃、空貨櫃其儲位以電腦控管並提供海關線上查核，經海關核准不分區存放者，不在此限。裝有危險物品之實貨櫃應有特別標誌並將其貨櫃號碼及儲位通知海關。

六、每一進口運輸工具同一航次所卸貨物，應依載貨證券分別堆置，不得與該運輸工具其他航次或其他運輸工具所卸貨物混淆，轉口貨物應與一般進口貨物分別堆置，不得相混。

七、凡貨物之包件過重或體積過大無法存入站內倉庫者，經海關核准，得在集散站之空地存放，但須將進出口、轉運貨物分區堆置，其安全與管理仍由該集散站業者負責。

八、存站之進口或轉運國內其他口岸貨物，集散站業者應憑海關放行通知、提貨單、轉運准單或其他經海關核准之文件核對收貨人、貨物之標記、箱號及件數無訛後方准提貨出站。其為整裝貨櫃，並應核對貨櫃標誌、號碼無訛後始准提櫃出站。海關必要時得予抽核；對整裝貨櫃並得要求貨主拆櫃核對貨物之標記、箱號及件數。對轉運國內其他口岸之進口貨櫃，進口轉運地海關亦得要求拆櫃抽驗，必要時得取樣備查。

九、存站之進口、出口或轉運國內其他口岸貨物，如須公證、抽取貨樣、看樣或進行必要之維護者，貨主應向海關請領准單，集散站業者須憑准單指示在關員或其專責人員監視下辦理。至於所拆動之包件，應由貨主恢復包封原狀。

十、存站之進口、轉運貨櫃(物)，如有短、溢卸情事，集散站業者應於下列期限內繕具短卸或溢卸報告送達海關。該短卸或溢卸報告如須註銷或更正者，應於報告送達海關翌日起三日內為之。　　　

（一）櫃裝貨物：拆櫃完畢之翌日起三日內。　　　　
（二）非櫃裝貨物：全部進儲完畢之翌日起七日內。
（三）整櫃、貨主自備空櫃：卸船完畢之翌日起一日內。　　　　　　

十一、海關依據海關緝私條例或其他規定處理之集散站存貨，得憑海關扣押貨物收據隨時押存海關倉庫，必要時得拆櫃押存海關倉庫，集散站業者不得拒絕。

十二、以貨櫃裝運之進口貨物，如有破損情事，集散站業者應於貨櫃拆櫃進倉之翌日起三日內檢具運輸業事故證明單一式兩份，送交海關查核。

十三、以貨櫃裝運之出口貨物，因故未能出口者，應憑駐庫（站）關員簽證之文件辦理退關手續。

十四、集散站應於實貨櫃進站及出站時負責於貨櫃（物）運送單註明進、出站時間，貨櫃（物）進站如逾海關規定時間，應即報請海關處理。

集散站業者應依海關規定格式，備具貨櫃及貨物存站紀錄簿冊或建置電腦進倉總簿檔，對於貨櫃及貨物之存入、提出、抽取貨樣或其他海關規定之事項，均須分別詳細立即登載，海關得隨時派員前往集散站檢查貨物及簿冊或要求查閱或印取有關資料，集散站業者不得拒絕。

海關並得要求集散站業者將貨櫃及貨物之存入、提出資料傳送海關查核。

轉口貨物及貨櫃在集散站或碼頭專區之存放、移動及處理，依下列規定辦理：

一、轉口之實貨櫃，無須加裝、分裝或改裝，且其裝載之貨物亦無須重整者，於卸存期間，不得拆櫃卸貨進倉。

二、海運轉口貨櫃（物），經由海運轉運出口者，不得以內陸運輸方式運送至內陸貨櫃集散站或其他港口辦理出口。

三、集散站或碼頭專區，應劃定特別區域用以堆置轉口之實貨櫃，不得與裝運進出口貨物之貨櫃相混雜，必要時海關得要求加設隔離設施。但其儲位以電腦控管並提供海關線上查核經海關核准不分區存放者，不在此限。

四、轉口貨櫃卸存集散站或碼頭專區，其運輸業者須申請普通卸貨准單及特別准單憑以卸船及進儲。轉運出口時，運輸業者應以轉運申請書向海關申請核發轉運准單憑以辦理出站及裝船手續。

五、轉口之實貨櫃須加裝、分裝或改裝，或其裝載之貨物須重整者，應事先以書面載明貨櫃標誌、號碼、封條號碼及貨物品名、數量，向海關申請，經核准後，於集散站（或碼頭專區）內之轉口倉庫或其他經海關核准之場所辦理，海關於必要時，得派員查核。

六、非櫃裝轉口貨物須裝櫃者，應事先以書面載明貨物品名、數量向海關申請，經核准後，於關員監視下在散裝碼頭進口貨棧內之轉口倉庫或其他海關核准之場所辦理裝櫃。運輸業者並應另將貨櫃標誌、號碼及封條號碼載明於轉運申請書及貨櫃清單，並填寫貨櫃(物)運送單，申辦移儲轉口貨櫃專區內，如係移儲於同一區段碼頭轉口櫃專區內者，免填貨櫃(物)運送單。

七、經海關核准轉運之轉口貨櫃（物），除海運轉口貨櫃（物）經由海運轉運出口者外，其須打盤、裝櫃者，海關得核准直接運往儲存一般出口貨物之貨棧、碼頭或內陸貨櫃集散站，在關員監視下辦理打盤、裝櫃作業。

前項第一款及第五款所稱重整者，以辦理貨物原來包裝之加裝、分裝、改裝及利用人力或簡單工具將貨物組合之裝配等作業為限。

集散站內之進口倉庫、出口倉庫及轉口倉庫比照海關管理進出口貨棧辦法之有關規定辦理；集散站內之保稅倉庫依保稅倉庫設立及管理辦法之規定辦理。
集散站業者應配合中央水利主管機關、地方政府、航政機關、警政機關及海關等有關機關勘察貨櫃堆置之安全管理。

裝運貨物進出口、轉運、轉口之貨櫃，卸存碼頭者，按一般卸存碼頭之進出口貨物處理。
運輸業者及貨櫃集散站業者辦理貨櫃卸船、裝船、出站、進站及存站手續，應依下列規定辦理：

一、集散站業者應擷取運輸業者以電子資料傳輸分送之進口艙單訊息及普通卸貨准單、特別准單（含貨櫃清單）訊息辦理存站手續。如未與通關網路連線者，則憑書面文件辦理之。

二、貨櫃卸存其他碼頭或內陸集散站須出碼頭管制站者，運輸業者列印貨櫃（物）運送單，應俟貨櫃加封後，隨同貨櫃送交貨櫃卸存地之集散站業者驗明貨櫃標誌、號碼及封條完整無訛後憑以點收進站，貨櫃（物）運送單應予留存，俾憑查核勾稽。

三、運輸業者及集散站業者應於貨櫃卸船、裝船、出站、進站及存站等各階段作業完畢，以電子資料傳輸辦理登錄作業。

前項卸船貨櫃之加封，海關得要求運輸業者在適當地點設立加封站，並指派足夠人員，專任對船卸下之實貨櫃加封工作，關員不定時巡查或抽核。
第二項貨櫃（物）之運送控管所需文件、電子資料傳輸及其作業規定，由海關訂定並公告。

工廠以整裝貨櫃裝運自用器材原料進口，海關得酌情核准直接卸存工廠候驗。該項貨櫃，應憑運輸業者及收貨工廠聯保單由海關簽發正副特別准單(附貨櫃清單)各一份，以正本送經辦關員加封後，准許運存該工廠負責保管，以副本送稽查單位，並按下列規定辦理：

一、經辦關員於加封時應填發貨櫃運送單(附密封貨櫃清單)隨同貨櫃送該工廠，於海關派員至工廠查驗時，原封遞交驗貨關員。

二、經驗貨關員驗明貨櫃封條完整並查驗貨物無訛後，即予放行，並將運送單附入有關進口報單；貨櫃清單簽證後加封送還原簽發單位與存底核對後銷案。

三、驗貨關員於查驗時如發現申報不實或短少、虛報等情事，應以隨身攜帶之封條予以加封不予放行，並即報請核辦。

前項貨櫃所裝之器材及原料，在未辦妥報關手續經海關放行以前，不得啟封移動。
加工出口區、科學工業園區內各工廠以整裝貨櫃裝運自用器材原料進口者，除有特別規定者外，準用第一項及前項之規定辦理。

集散站業者點收出口貨櫃(物)後應出具進倉證明，並立即傳送海關。
以貨櫃裝運之出口貨物經海關放行後，運輸業者應向海關申請核發封條或使用經海關核准使用之自備封條，由集散站業者辦理貨櫃加封作業，於貨櫃出站時列印貨櫃（物）運送單(兼出進站放行准單) ，並以電子資料傳輸辦理貨櫃出進站及裝船手續。但進碼頭貨櫃集散站之出口整裝貨櫃，經海關免驗放行，並在原碼頭裝船者，免加封海關封條。
前項貨物於辦妥報關放行手續後，即予放行。但海關認為有查驗必要時，得開櫃再驗，符合後始准裝船。
凡出口貨物未經海關核准，即行以整裝方式裝櫃者，集散站業者應對有關貨櫃過磅，並將重量詳載於進倉證明，以供海關查核；駐站關員對於此類貨櫃應核對貨櫃標誌、號碼及櫃數；驗貨關員認有將貨物全部檢出查驗之必要者，貨主應配合辦理，其因此而延誤班期或增加之任何費用，應由貨主自行負責。出口貨物以併裝方式裝櫃者，在海關放行前不得先行裝櫃。但集散站業者具有正當理由經事先申請並經海關核准者，不在此限。
以海運方式辦理之進口轉運貨櫃及代辦出口或轉口貨櫃，運輸業者應分別憑進口貨櫃清單或出口貨櫃清單辦理裝卸船作業，並傳輸貨櫃動態裝卸船訊息至通關網路，關員不定時巡查或抽核。

工廠以整裝貨櫃方式裝運成品出口，於裝貨入櫃前，經海關依其申請酌情核准派員到工廠依據出口報單查驗，經驗明無訛後，除應將有關出口報單送交出口單位核辦簽放手續外並應於監視裝櫃加封後，填發貨櫃(物)運送單及簽發出口貨櫃清單，該清單一份存查，另二份密封隨同貨櫃送交出口地海關關員驗明封條正常並憑海運出口貨物放行通知裝運後，一份留存稽查或倉棧單位，另一份經稽查或倉棧單位密封後退還原簽發單位，俾與存底核對後銷案；以電子資料傳輸辦理貨櫃出站、進站及出口裝船登錄作業，得免簽發出口貨櫃清單。
前項以貨櫃裝運之出口貨物於運抵出口地海關時，海關認為有查驗之必要時，仍得開櫃複驗。

業經海關查驗裝貨後之出口貨櫃，如須重行開櫃加裝、分裝或改裝者，應由運輸業者向海關申領特別准單或核准文件於關員監視下，在站內出口倉或站內指定專區辦理。
前項關員監視作業海關得責由集散站業者辦理，並由海關派員巡視或查核。

轉口之實貨櫃須起岸、加裝、分裝或改裝而未能在專營或兼營轉口貨物之集散站內辦理者，應由運輸業者向海關申領特別准單，於關員監視下在貨櫃起卸碼頭辦理加裝、分裝或改裝後，加封裝船。

實施通關自動化之海關依運輸業者之申請，對報裝貨櫃自國內其他港口或機場裝運出口之貨物，得代為辦理通關作業，並依第十四條規定辦理貨櫃（物）之控管。出口地海關於貨櫃出口後，不論貨物有無退關均應將銷艙不符清表及退關貨物清單各一份，寄回代辦海關備查。

運輸工具裝運貨櫃出口於結關時，運輸業者應將經船長或其指定人員簽署之出口貨櫃清單一式二份，遞送海關稽查單位經核明無訛後，一份存查，一份送出口單位附存於有關出口艙單或銷艙不符清表備查。
前項出口貨櫃清單以連線方式傳輸辦理者，應於結關後四十八小時內為之，並得免送書面出口貨櫃清單。

外銷國產貨櫃於初次出口時，不論其是否裝運貨物，均應依一般出口貨物之規定辦理出口報關手續。
前項外銷國產貨櫃，以空貨櫃立即報運出口者，得以船邊驗放方式辦理放行裝船。

前條外銷國產貨櫃，無法立即報運出口者，應按下列規定辦理出口手續：

一、應依出口貨物辦理進倉手續，將空貨櫃運存集散站集中存放，不得與其他貨櫃混合，未經完成報關驗放手續，不得隨便移動。

二、貨櫃進存集散站前，由其買主或代理人填具海運出口貨物進倉證明書，連同集散站出具之碼頭聯保單交駐站關員憑以點驗空貨櫃進站，駐站關員於點驗無訛後，應在海運出口貨物進倉證明書上予以簽證。

三、辦理出口報關時，應依照一般出口貨物之規定辦理，同時檢附買主或代理人簽收貨櫃之文件。出口報單除應載明貨櫃隻數、標誌、號碼、規格、淨重、價值等資料外，並應加附外銷品使用原料及其供應商資料清表；但保稅工廠產製者得免附。

四、完成出口報關手續之外銷國產貨櫃，除保稅工廠產製者外，應俟裝船出口後，始由出口簽證單位核發出口報單副本供出口廠商辦理退稅。

五、保稅工廠外銷之國產貨櫃得免進儲集散站，逕向其監管海關之出口單位辦理出口通關作業。

六、保稅工廠應對前款外銷國產貨櫃於出口報單放行後半年內自行依運輸業者開具之出口證明文件按報單號碼逐案逐櫃核銷送監管海關備查。

以貨櫃裝運貨物進出口時，除所裝運之貨物應依規定申報外，貨櫃本身免另具報單申報，並免驗輸入、輸出許可證。

未經簽發提單（裝貨單）之空貨櫃，進口時應將貨櫃標誌、號碼、數量列報於進口艙單最後一頁並免加列艙單號碼；出口時應填具出口貨櫃清單向海關申請核發特別准單。裝卸櫃時，並應由運輸業者指派足夠人員專任開啟空貨櫃受檢工作，以便關員檢查，俟裝卸完畢後，由其指派人員簽認實際裝卸數量及號碼，以備海關查核。

第十二條第二項、第十四條第二項規定駐站關員辦理事項及第九條第二款、第六款、第十一條第二項、第十四條第五項、第十六條、第二十三條規定之海關辦理事項，得由經海關核准實施自主管理之集散站自行辦理。
第七條第十三款及第十四條第二項規定駐庫(站)關員簽證之文件及第十四條第二項、第十六條第一項規定關員監視之事項，經海關核准實施自主管理之集散站得免辦理。
第七條第四款規定應在海關辦公時間內辦理之事項，經海關核准自主管理之集散站，不在此限。
第七條第二款、第四款、第九款及第九條第二款、第六款規定應由海關監視事項，經海關核准自主管理之集散站，海關未派駐站關員監視者，免徵收特別監視費。

集散站業者有欠繳稅款、規費或罰鍰時，海關得就其所繳保證金抵繳。
保證金因前項抵繳而不足時，集散站業者應於海關通知之翌日起一個月內補繳其差額。

集散站業者違反第四條第六項、第九條第三款、第十條第二項、第十二條第二項、第三項、第十四條第二項規定，海關得依關稅法第八十六條規定，予以警告並限期改正或處新臺幣六千元以上三萬元以下罰鍰；並得連續處罰；連續處罰三次仍未完成改正者，得停止六個月以下進儲貨櫃及貨物或廢止其登記。　

集散站業者違反第五條第一項、第六條、第七條第一款、第五款、第六款、第七款、第八條、第十四條第一項、第五項規定，海關得依關稅法第八十六條規定，予以警告並限期改正或處新臺幣六千元以上一萬五千元以下罰鍰；並得連續處罰；連續處罰三次仍未完成改正者，得停止六個月以下進儲貨櫃及貨物或廢止其登記。

集散站業者違反第七條第三款、第八款、第十三款、第十四款、第九條第一款、第四款、第五款規定，海關得依關稅法第八十六條規定，處新臺幣六千元以上二萬元以下罰鍰。

集散站業者違反第七條第四款、第九款、第十款、第十二款、第十四條第三項、第四項規定，海關得依關稅法第八十六條規定，處新臺幣六千元以上一萬五千元以下罰鍰。

集散站業者違反第七條第十一款、第九條第六款、第十六條、第二十一條第一款至第四款、第六款規定，海關得依關法第八十六條規定，處新臺幣六千元以上三萬元以下罰鍰。

集散站業者不依第二十五條規定補足差額者，海關得依關稅法第九十三條第二項規定，停止六個月以下業務之經營或廢止其登記。